جستجو در سایت : عنوان یا موضوع مورد نظر خود را در کادر زیر وارد کنید و enter بزنید

Loading
09354382544

آموزش docking دستی با Chimera

19,000 تومان

توضیحات

Docking یک ترم است که تعداد زیادی از الگوریتم های پیچیده را شامل می شود که مکان یابی مناسب لیگاندهای rigid و flexible در binding site گیرنده را پیدا می کند.
لیگاندها اغلب یک مولکول کوچک هستند ; الگوریتم های داکینگ peptide-protein و protein-protein اکنون یکی از موضوعات داغ تحقیقات می باشد.
الگوریتم های docking یک نمره یا امتیاز به مولکولها می دهند تا بین مولکولهایی که جانمایی آنها مناسب باشد و مولکولهایی که جانمایی مناسبی ندارند، برای کاربر تمایز ایجاد شود.
در حالت واقعی، محاسبات docking نیاز به آماده سازی دقیق گیرنده و ساختار لیگاند دارد. این آماده سازی با نرم افزارهایی مانند Chimera بسیار ساده شده است. این نرم افزار بسیار قدرتمند و دارای منوهای مختلف می باشد و همچنین توانایی آنالیز نتایج نهایی docking را هم دارد.

سرفصل :

بارگذاری پروتئین در UCSF Chimera
آماده سازی برای dock
اضافه کردن بار
AM1-BCC
Gasteiger
لیگاند macrocyclic
Isomeric SMILES
Conformer
مینیمم سازی ساختار
انتخاب mode مد ماوس
انتخاب چندین اتم
انتخاب همه اتم ها
تنظیم torsion
چرخاندن اتم ها
چرخاندن معکوس اتم ها
بهینه سازی فضایی و هندسی
Chimera docking
AutoDock Vina

دیدگاهها

هیچ دیدگاهی برای این محصول نوشته نشده است.

اولین نفری باشید که دیدگاهی را ارسال می کنید برای “آموزش docking دستی با Chimera”

نشانی ایمیل شما منتشر نخواهد شد. بخش‌های موردنیاز علامت‌گذاری شده‌اند *

پشتیبانی